François Mabille a mené conjointement des études à Sciences-Po et un cursus d'histoire et d'anthropologie religieuse à l'université Paris IV. Il a longtemps enseigné à l'Institut catholique de Paris, à la faculté des sciences sociales et économiques dans le cadre de laquelle il a fondé le Centre de recherches sur la paix puis, après avoir achevé sa thèse, il a rejoint l'université catholique de Lille. Il est associé à la chaire Raoul Dandurand en études stratégiques et diplomatiques de l'UQAM, Université Québec à Montréal ainsi qu'au Centre d'études sur les conflits de l'université Saint Paul d'Ottawa, au Canada anglophone. La plupart de ses livres traitent du rôle de l'Eglise dans la lutte contre les conflits : Las catholiques et la paix au temps de la guerre froide, Les ONG confessionnelles : religions et action internationale mais certains étudient la question de façon plus large, Les sociétés au risque des conflits. Perspectives internationales ou Politique, démocratie et développement. Du local au global. Il a aussi fait paraître, quelques mois avant sa renonciation, un ouvrage sur le pape Benoît XVI, Benoît XVI ou la désacralisation des souverains pontifes.